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    實時熒光定量 PCR 操作流程及注意事項--RNA模板的制備

    發(fā)布時間: 2025-02-26  點擊次數(shù): 656次
    一、RNA模板的制備
    常見的RNA提取的方法:傳統(tǒng)的酚CHCl?抽提法和柱式抽提法。
    操作流程概要
    酚CHCl?抽提法
    以 Vazyme 產(chǎn)品 RNA isolater Total RNA Extraction Reagent (Vazyme #R401) 為例
    自備材料
    CHCl?,異丙醇,75% 乙醇 (DEPC 水配制 ),DEPC 水
    組分
                                                                                                                                                                                                             
    樣本制備(過多的樣本量可能會導(dǎo)致樣本裂解不充分,并使產(chǎn)物純度降低;)
    1ml RNA is olater 能夠充分裂解的最大樣本量如下:                                                                                                                                                                                                                                                                  
    貼壁細胞(對于貼壁牢固的細胞可用細胞刮勺剝離細胞)
    1.棄培養(yǎng)液,PBS 洗滌一次。
    2.每 10 cm2 培養(yǎng)面積的細胞加入 1-3 ml RNA isolater,使之充分覆蓋到細胞表面,
    然后用移液器將細胞吹打下來。
    3.將裂解液轉(zhuǎn)移至 1.5 ml 離心管中,用移液器反復(fù)吹打直至無明顯顆粒樣存在。

    冰上靜置 5 min


    懸浮細胞
    1、離心收集細胞,PBS 洗滌一次。
    2、每 5 ⅹ 106 -107 個細胞加入 1 ml RNA isolater。

    3、用移液器反復(fù)吹打直至無明顯顆粒樣存在。冰上靜置 5 min。


    動物組織
    液氮研磨(部分研磨會影響 RNA 的得率和質(zhì)量):
    1、將液氮研磨的粉末立即轉(zhuǎn)移至離心管中,加入 RNA isolater 裂解液,靜置。待樣品全部融化后,再繼續(xù)吹打至裂解液透明。
    2、將裂解液轉(zhuǎn)移至離心管中,12,000 × g 4℃離心 5 min,吸取上清。
    勻漿處理:
    1、可將新鮮組織盡量剪碎浸泡在 RNA isolater 裂解液中,用電動勻漿器高速勻漿,將組織全部研磨均勻。
    2、將裂解液轉(zhuǎn)移至離心管中,12,000 × g 4℃離心 5 min,吸取上清。

    提取流程        
    實時熒光定量 PCR 操作流程及注意事項--RNA模板的制備                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    
    柱式抽提法

    以 Vazyme 產(chǎn)品 FastPureTM Cell/Tissue Total RNA Isolation Mini Kit (Vazyme #RC101/RC111) 為例


    自備材料
    組分
    β- 巰基乙醇、無水乙醇、RNase-free 槍頭等。

    實時熒光定量 PCR 操作流程及注意事項--RNA模板的制備
    培養(yǎng)細胞
    貼壁細胞:

    無需消化,可直接使用 Buffer RL1( 已加入 β- 巰基乙醇 ) 進行消化、裂解;或用胰酶消化后離心收集細胞加入 Buffer RL1( 已加入 β- 巰基乙醇 ),每 2-5×106 個細胞加入 500 μl Buffer RL1。用移液器反復(fù)吹打混勻直至看不到細胞團塊。(使用前在 Buffer RL1 加入 β- 巰基乙醇至終濃度為 1%(如1 ml Buffer RL1 中加入 10 μl β- 巰基乙醇),盡量現(xiàn)配現(xiàn)用)


    懸浮細胞:
    直接離心收集細胞,加入 Buffer RL1( 已加入 β- 巰基乙醇 ),每 2-5×106 個細胞加入 500 μl Buffer RL1,用移液器反復(fù)吹打混勻直至看不見細胞團塊。(每 2-5×106 個細胞加入 500 μl Buffer RL1,細胞裂解完后若不立即進行下一步操作,可以置于 -70℃、保存)
    提取流程
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